Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX16O60231 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX16O60231 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX16O60231 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX16O60231 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX16O60231 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX16O60231 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHX16O60231 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX16O60231 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms