Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KIF1CO43896 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIF1CO43896 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms