Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCO2O43819 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCO2O43819 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCO2O43819 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCO2O43819 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCO2O43819 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms