Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD51CO43502 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms