Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA3O43365 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms