Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRRTM2O43300 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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