Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD3O43242 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMD3O43242 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD3O43242 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms