Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF1O43189 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF1O43189 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF1O43189 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF1O43189 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF1O43189 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms