Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2DO15399 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2DO15399 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms