Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK1O15075 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK1O15075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms