Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYNJ2O15056 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNJ2O15056 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ2O15056 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms