Protein–RNA interactions for Protein: O00764

PDXK, Pyridoxal kinase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXKO00764 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXKO00764 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXKO00764 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXKO00764 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXKO00764 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXKO00764 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXKO00764 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDXKO00764 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDXKO00764 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDXKO00764 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDXKO00764 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDXKO00764 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms