Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLRMTO00411 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms