Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAPO00193 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAPO00193 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAPO00193 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAPO00193 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAPO00193 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAPO00193 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAPO00193 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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