Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QKU1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QKU1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QKU1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QKU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QKU1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QKU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QKU1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QKU1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QKU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QKU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms