Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01387J3KSC0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01387J3KSC0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms