Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
I3L3M4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
I3L3M4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
I3L3M4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
I3L3M4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
I3L3M4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms