Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L21D6R901 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L21D6R901 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms