Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L12C9JPN9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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