Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9J4A7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9J4A7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9J4A7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9J4A7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9J4A7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9J4A7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9J4A7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9J4A7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms