Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9IYK1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9IYK1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9IYK1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9IYK1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9IYK1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9IYK1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9IYK1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9IYK1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms