Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR42E2A6NKP2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms