Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC10BA6NIK2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms