Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01546A6NGU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms