Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf60A6NFR6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms