Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L3A6NEY3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L3A6NEY3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms