Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6CA6NDK9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms