Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms