Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
U3KQE9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
U3KQE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
U3KQE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U3KQE9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U3KQE9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U3KQE9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U3KQE9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms