Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP3K4Q9Y6R4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms