Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms