Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms