Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NRXN3Q9Y4C0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRXN3Q9Y4C0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRXN3Q9Y4C0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms