Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF330Q9Y3S2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms