Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX24Q9Y343 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms