Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC4Q9Y296 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms