Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HHLA3Q9XRX5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms