Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNND2Q9UQB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNND2Q9UQB3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms