Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9BQ9UPX0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms