Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms