Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms