Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZRN3Q9UPQ7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms