Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCML1Q9UN30 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCML1Q9UN30 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms