Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP18Q9UMW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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