Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC7AQ9ULT0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC7AQ9ULT0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms