Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMFRQ9UKV5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms