Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MID2Q9UJV3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MID2Q9UJV3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MID2Q9UJV3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MID2Q9UJV3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MID2Q9UJV3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 828.3 ms