Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms