Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms