Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUSD2Q9UGT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUSD2Q9UGT4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268 ms